Lise yıllarında ilk ciddî musiki derslerini aldı. Güzel Sanatlar Akademisi’nde öğrenciyken Üsküdar Musiki Cemiyeti’nin ve Üniversite Korosu’nun çalışmalarına katıldı; Kemal Batanay’dan usûl ve repertuar, Kâmran Erdoğru’dan kemençe dersleri aldı. 1976’da felsefe öğrenimine başladı. 1977-1982 arasında Fransızca öğrendi. TRT’nin 1981’de açtığı sınavı kazandı ve kemençe sanatçısı olarak İstanbul Radyosu’na alındı. 1980-1996 arasında, ansiklopediler için müzik maddeleri yazdı, Fransızcadan çeviriler yaptı. 1995’te Bezmârâ projesi üzerinde çalışmaya başladı. 16. ve 17. yüzyıl eserlerini, o dönemin unutulmuş çalgılarıyla seslendirmek üzere kurduğu Bezmârâ topluluğu için, çeng, eski santur, eski kanun, mıskal ve kemânçe yaptı. Görsel ve yazılı kaynaklardan hareketle, şehrud, kopuz, eski ud ve eski tanbur için çizimler ve şablonlar hazırlayarak bu çalgıları yaptırdı. Karakaya’nın çeng çaldığı ve yönettiği Bezmârâ, 1998’den itibaren yurt içinde ve dışında birçok konser verdi, 11 albüm yayınladı.

Dört yeni makam düzenleyen ve bunlara örnek olmak üzere çeşitli saz eserleri besteleyen Karakaya, Eski Musikinin Rüzgârıyla (2009) adlı albümde kendi bestelerini icra etti.